空間や時間を自由に書き換えられる改変能力を手に入れたジョーカーは、宇宙の皇帝となってしまった……。　皇帝ジョーカーは、宿敵であるバットマンを繰り返し痛めつけることに喜びを感じ、全世界を残酷非道な世界へと変えてしまった。　だが、そんな世界に立ち向かう男がただ一人いた……　スーパーマンはバットマンと宇宙の運命を救うことができるのか！？

ゴッサムシティでは、今日もいつも通りの日常が繰り返されていた。世界一危険な犯罪者スーパーマンがアーカム・アサイラムから脱獄。それを捕まえるため空を駆けるのは、世界一の英雄ビザロ！…ってちょっと待って！？この世界は私たちの知る世界と違う。なんてったって創造神がジョーカー様なのだから！そう、神の力を得たジョーカーが、世界を混沌としたものに改変してしまったのだ。元の世界の記憶なんて誰も持っていない！ジョーカーに逆らうことができるのはただ一人だけ！スーパーマンは鋼の意思で、世界の皇帝ジョーカーを打ち破ることができるのか！？