色々あって離島で工房を開くことになった錬金術師の少女・フレイア。島の守り神である幻獣リルリルと、島を荒らしていたロック鳥のナーティアを弟子に迎え、今日も今日とて島民の生活向上の（という建前で、自分が毎日だらだらする）ためのものづくりに挑む。島内のインフラ向上のため転送魔法を改良したり、現金を持ちたくないので新しい決済システムを作ったり、サボる（直球）ために透明薬を開発したり。こうしたフレイアの活躍で、島の生活はますます改善していくのだが、ある日、王都から彼女と因縁のある「万年二位」の錬金術師が乗り込んできて―！？