エイリアンによって制圧された地球を後にした生存者、ウィルクスとビリー。しかし彼らの乗った宇宙船にはエイリアンが潜んでいた。エイリアンを何とか退けた２人だったが、船は自動操縦で軍の基地へと着陸してしまう。そこで行われていたのは、エイリアンを軍隊として培養するおぞましい計画であった…滅びゆく地球、滅びゆく人類。己の過去、エイリアンとの因縁に決着をつけるため、あのリプリーがついに動き出す。彼女の計画とは…「クイーン」の捕獲！？「ナイトメア・アサイラム」「フィメール・ウォー」の２編を収録した、特大ボリュームで送るクラシック・コレクションの下巻、ついに登場。